康熙、雍正兩朝，是清代國(guó)力上升的時(shí)期，清廷對(duì)西北回民的基本態(tài)度，是“一視同仁”。康熙年間，北京曾有官員誣告牛街回民夜聚明散、圖謀造反，主張全城屠滅，康熙微服私訪查明實(shí)情后，不僅嚴(yán)懲了誣告官員，還下旨曉諭各省：不許借小事誣告回民謀反，違者先斬后奏。這道圣旨后來(lái)被回民刻在牛街禮拜寺的石碑上，成了清代前期民族政策相對(duì)寬松的佐證。

雍正二年，山東巡撫陳世倌上奏，痛陳回民“不敬天地、不祀神祇、另立宗主”，要求拆毀各地禮拜寺，強(qiáng)迫回民出教，不許回民出仕做官。雍正帝看完奏折后批復(fù)，認(rèn)為回教由來(lái)已久，雖然不足取，但強(qiáng)行禁革只會(huì)徒生紛擾，批評(píng)陳世倌行事操切。

雍正七年，陜西總督岳鐘琪也上奏表示，回民結(jié)黨好斗、風(fēng)俗特異，令人疑慮，雍正帝同樣下諭內(nèi)閣強(qiáng)調(diào)，回民都是朝廷編氓、國(guó)家赤子，地方官要像治理普通百姓一樣治理回民，不能另眼相看。

但皇帝的公開(kāi)表態(tài)，并沒(méi)有真正消解朝野的偏見(jiàn)。地方官處理回漢糾紛時(shí)，普遍存在偏袒漢民、壓制回民的傾向；各級(jí)官員的奏折里，也反復(fù)出現(xiàn)“回民強(qiáng)悍”“回民結(jié)黨為匪”的表述。更關(guān)鍵的變化發(fā)生在法律層面：針對(duì)回民的專(zhuān)門(mén)律例，正在悄然增加。

乾隆二十七年，山東按察使閔鶚元上奏稱(chēng)，回民獷悍成習(xí)，結(jié)伙盜竊的情況太多，按普通律例處罰不足以震懾，建議今后回民結(jié)伙三人以上、攜帶兇器行竊的，不論贓數(shù)多少、次數(shù)多少，全部發(fā)配云貴兩廣極邊煙瘴之地充軍，窩贓、分贓的一并治罪。乾隆帝直接批復(fù)“從之”，這條內(nèi)容就此寫(xiě)進(jìn)了《大清律例》。

乾隆三十八年，刑部又議準(zhǔn)甘肅按察使圖桑阿的奏請(qǐng)，規(guī)定回民結(jié)伙三人以上搶奪的，不分首從全部發(fā)黑龍江給兵丁為奴，逃跑就直接正法。哪怕不到三人，只要有持械逞強(qiáng)情節(jié)，也發(fā)極邊煙瘴充軍。對(duì)比普通百姓的搶奪律，回民的量刑明顯重了一個(gè)等級(jí)。

明清之際，伊斯蘭蘇非主義從中亞、西亞傳入中國(guó)西北，和本土社會(huì)結(jié)合后，形成了一套被稱(chēng)為“門(mén)宦”的宗教組織制度?？滴醯角〕跄辏⒎蛞?、嘎得仁耶、庫(kù)布仁耶、哲赫仁耶四大門(mén)宦相繼創(chuàng)立，每個(gè)門(mén)宦都有自己的教主、道統(tǒng)和教區(qū)，教權(quán)高度集中。對(duì)清廷來(lái)說(shuō)，這種跨地域、有組織的宗教體系，本質(zhì)上是對(duì)基層管控權(quán)的挑戰(zhàn)。但乾隆前期，朝廷還沒(méi)意識(shí)到其中的風(fēng)險(xiǎn)，只把教派之爭(zhēng)當(dāng)成民間糾紛。

乾隆十二年，河州回民馬來(lái)遲創(chuàng)立的花寺門(mén)宦，和傳統(tǒng)格迪目教派因?yàn)椤扒伴_(kāi)齋”“后開(kāi)齋”的儀式差異鬧到官府，地方官審理后，判定兩派各遵祖教，互不干涉，草草了結(jié)了中國(guó)伊斯蘭教史上第一場(chǎng)官方介入的教爭(zhēng)。沒(méi)人想到，三十多年后，同樣的教派沖突，會(huì)演變成一場(chǎng)震驚全國(guó)的反清起義，徹底扭轉(zhuǎn)清代治回政策的走向。

乾隆二十六年，河州人馬明心從也門(mén)求學(xué)歸來(lái)，傳入了另一支蘇非教派哲赫仁耶。他主張教權(quán)傳賢不傳子，少收布施、周濟(jì)窮人，宗教儀式上高聲念經(jīng)、搖頭禮拜，因此被稱(chēng)為“新教”。新教教義簡(jiǎn)單、門(mén)檻低，很快吸引了大批底層信眾，和馬來(lái)遲創(chuàng)立的“老教”花寺門(mén)宦形成了正面競(jìng)爭(zhēng)。

兩派在循化撒拉族地區(qū)的沖突尤為激烈，從互相控訴到聚眾械斗，愈演愈烈。乾隆四十六年正月，新教首領(lǐng)蘇四十三、韓二個(gè)率眾擊殺老教教長(zhǎng)韓三十八，老教家屬赴蘭州告狀。陜甘總督勒爾謹(jǐn)派蘭州知府楊士璣、河州副將新柱帶兵前往查辦，新柱到任后公開(kāi)揚(yáng)言，要為老教做主、洗清新教。蘇四十三得知后，索性率眾突襲衙門(mén)，殺死新柱、楊士璣等人，順勢(shì)攻下河州城，起義就此爆發(fā)。

隨后蘇四十三率眾三千直撲蘭州，要求官府釋放被扣押的馬明心。甘肅布政使王廷贊一邊據(jù)城死守，一邊下令處死馬明心。清廷急調(diào)阿桂、和珅率大軍赴甘鎮(zhèn)壓，經(jīng)過(guò)四個(gè)月苦戰(zhàn)，起義軍退守華林山，最終全軍覆沒(méi)，蘇四十三戰(zhàn)死。

這場(chǎng)由教派沖突引發(fā)的起義，徹底激怒了乾隆帝。在他看來(lái)，新教就是“邪教”，是煽動(dòng)回民作亂的根源，因此下旨徹底鏟除新教，永絕后患。

起義首領(lǐng)馬明心、蘇四十三等人雖已戰(zhàn)死，仍被挫骨揚(yáng)灰。阿桂率軍分赴循化、河州、安定官川等地搜捕新教余黨，凡是信新教的，無(wú)論是否參與起義，一概正法，家屬全部發(fā)遣。撒拉族十二工里，九工的新教信眾幾乎被屠戮殆盡，九百多戶(hù)人家殲除殆盡。搜捕范圍甚至擴(kuò)大到陜西臨潼、山西蒲州等地，只要是馬明心的教下，全部押解回蘭州正法，前后被殺、發(fā)遣的無(wú)辜回民不下八百人。

清廷明確扶持老教、禁絕新教，下令拆毀所有新教清真寺，革除總掌教、掌教、阿洪等宗教名目，改由官府挑選老成回民充當(dāng)鄉(xiāng)約，負(fù)責(zé)稽查教民、約束行為。循化地區(qū)的掌教直接改成總練，阿洪改成鄉(xiāng)約，全部由官方任免。同時(shí)推行保甲制度，回民聚居區(qū)十戶(hù)為牌、十牌為甲、十甲為保，設(shè)牌頭、甲長(zhǎng)、保正，和掌教互相監(jiān)督，一年沒(méi)有事端就給獎(jiǎng)勵(lì)，出了問(wèn)題一并連坐。

蘇四十三事件后，各地奉旨嚴(yán)查邪教書(shū)籍，乾隆四十六年，西安回民馬中杰等人在山西靈石被盤(pán)查，只因書(shū)信里有“掌教”二字，就被當(dāng)成邪教余黨，層層審辦，最后乾隆帝自己都覺(jué)得辦得太過(guò)分，才草草結(jié)案。

田五起義的爆發(fā)，在清廷看來(lái)，是蘇四十三后的善后還不夠嚴(yán)、不夠徹底。因此這次的善后措施，比三年前更進(jìn)了一步。

起義剛平定，清廷就下令在甘肅各地添兵設(shè)汛，查抄了鹽茶、靜寧、隆德等十五個(gè)廳州縣的回民財(cái)產(chǎn)，共計(jì)五萬(wàn)一千四百多畝田地、三千八百多間房屋、六百多處土窯全部充公，拆毀禮拜寺七十三座。大量回民失去土地與財(cái)產(chǎn)，徹底淪為赤貧。