本文來源于海潮天下（Marine Biodiversity）

海潮天下·導(dǎo)讀

Ocean Census是一個(gè)全球性的深海生物多樣性協(xié)作計(jì)劃，試圖把深海物種從采集、數(shù)字化到共享分析的流程提前并串聯(lián)起來，讓新物種在更早階段就進(jìn)入全球科研網(wǎng)絡(luò)。它不改變分類學(xué)規(guī)則本身，但改變了信息進(jìn)入科學(xué)體系的速度與方式，使原本分散、滯后的深海數(shù)據(jù)開始以更連續(xù)的形式被組織和使用。

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出品 | 海潮天下

深海里還有多少物種沒有被正式記錄，人類其實(shí)一直沒有準(zhǔn)確答案。

過去幾十年，海洋調(diào)查技術(shù)進(jìn)步很快。深海機(jī)器人、載人潛器、高通量測序已經(jīng)能夠讓科學(xué)家不斷從海底帶回新的樣本。但另一個(gè)問題始終沒解決：樣本采回來了，不等于物種已經(jīng)進(jìn)入科學(xué)體系。

在傳統(tǒng)分類學(xué)流程里，一個(gè)新物種從采集、鑒定到最終發(fā)表，往往要經(jīng)歷漫長周期。研究者需要查閱大量歷史文獻(xiàn)，與全球博物館中的模式標(biāo)本進(jìn)行比對，再經(jīng)過同行評議和期刊排期。整個(gè)過程平均耗時(shí)約13.5年。很多深海樣本因此長期停留在“待描述”狀態(tài)，有些甚至在正式發(fā)表前，采集它們的項(xiàng)目就已經(jīng)結(jié)束了。

“海洋生物普查”（Ocean Census）最初就是針對這個(gè)問題建立的。

圖片來源：ocean cencus

三歲看老……？

2023年，日本財(cái)團(tuán)（The Nippon Foundation）與英國海洋探索機(jī)構(gòu)Nekton共同發(fā)起“海洋生物普查”（Ocean Census）計(jì)劃，希望加快全球海洋新物種的發(fā)現(xiàn)與鑒定。到2026年5月，項(xiàng)目公布的數(shù)據(jù)是：第三個(gè)年度周期內(nèi)新增發(fā)現(xiàn)1121個(gè)海洋新物種，物種鑒定與發(fā)表效率較此前提高54%。

2023年那次發(fā)布會現(xiàn)場。圖片來源：Ocean Census的啟動會議

它并不是靠單純增加航次數(shù)量實(shí)現(xiàn)提速，而是改了整套物種發(fā)表流程。

傳統(tǒng)分類學(xué)非常依賴實(shí)體標(biāo)本。一個(gè)樣本被采集后，往往需要在不同國家和研究機(jī)構(gòu)之間寄送，由不同專家反復(fù)觀察確認(rèn)。尤其深海生物分類，本來專家數(shù)量就有限，很多類群全球可能只有少數(shù)幾個(gè)人能做準(zhǔn)確鑒定。

Ocean Census沒有繼續(xù)沿用這套完全依賴實(shí)體標(biāo)本流轉(zhuǎn)的模式，而是先把物種“數(shù)字化”。

該項(xiàng)目提出了“數(shù)字生命形態(tài)”（Digital Life Forms，DLFs）的概念。簡單來說，就是樣本剛被采集時(shí)，研究人員會立即對它進(jìn)行數(shù)字記錄，包括高分辨率顯微成像、三維CT掃描、組織基因測序，以及采樣海域的環(huán)境DNA數(shù)據(jù)采集。

上圖來源：ocean cencus

很多工作直接在船上完成。

例如CSIRO的“調(diào)查者”號和施密特海洋研究所的“法爾科2”號，都配備了能夠進(jìn)行快速數(shù)字化處理的實(shí)驗(yàn)條件。樣本一離開深海環(huán)境，研究人員就開始建立數(shù)字檔案，而不是等樣本運(yùn)回實(shí)驗(yàn)室后再慢慢處理。

這些數(shù)據(jù)隨后會進(jìn)入Ocean Census與聯(lián)合國環(huán)境規(guī)劃署世界保護(hù)監(jiān)測中心（UNEP-WCMC）合作建設(shè)的平臺，叫NOVA。上傳之后，全球研究人員都可以查看。截至2026年5月，該平臺已發(fā)布1121個(gè)新海洋物種數(shù)據(jù)，全部來自上述科考船的船上數(shù)字化成果。

這一步帶來的變化其實(shí)很大。

過去，一個(gè)新物種在論文正式發(fā)表之前，外界通常不知道它的存在?，F(xiàn)在則變成：物種數(shù)據(jù)先進(jìn)入全球數(shù)據(jù)庫，再逐步完成正式分類發(fā)表。原本需要數(shù)年的“等待期”，被壓縮到了幾小時(shí)到幾天。

“海洋普查”項(xiàng)目公布的新紀(jì)錄物種：一種新的犁頭鰩。圖片來源：◎ The Nippon Foundation-Nekton Ocean Census/Peter Stahlschmidt 2025

同行評議方式也跟著發(fā)生了變化。

傳統(tǒng)分類學(xué)審稿通常是封閉式的。編輯找?guī)孜荒涿麑＜遥瑢徃逡庖姴粫_，外界也不知道中間發(fā)生了哪些爭議。Ocean Census則更接近協(xié)作網(wǎng)絡(luò)。

目前，這個(gè)項(xiàng)目已經(jīng)連接了650多家海洋研究機(jī)構(gòu)、800+名分類學(xué)家。當(dāng)一個(gè)潛在新物種上傳后，系統(tǒng)會自動通知相關(guān)領(lǐng)域研究人員。不同國家的專家可以同時(shí)查看形態(tài)圖像、CT結(jié)構(gòu)和DNA序列，直接在線討論。

一些深海物種就是在這種模式下快速完成鑒定的。

比如西澳大利亞珊瑚海公園發(fā)現(xiàn)的一種深海幽靈鯊新種，以及日本七曜海山群玻璃海綿內(nèi)部發(fā)現(xiàn)的共生鱗沙蠶新種，都經(jīng)歷了多國研究者同步參與的開放式鑒定過程。相比傳統(tǒng)模式里漫長的郵件往返和期刊審稿，這種協(xié)作效率明顯更高。

▲上圖：在最近的珊瑚海深?？瓶贾校茖W(xué)家們鑒定出一種屬于光尾鯊屬（Apristurus）的深海貓鯊新物種。圖源：CORAL SEA FRONTIER科學(xué)項(xiàng)目，CSIRO

Ocean Census另一個(gè)比較特殊的地方，是它非常強(qiáng)調(diào)數(shù)據(jù)一起開放，而不是只公開最終論文。

傳統(tǒng)物種論文里，真正被長期保存和傳播的，通常只有拉丁學(xué)名、形態(tài)描述和幾張圖版。至于采樣環(huán)境、水文條件、周邊生態(tài)數(shù)據(jù)，很多時(shí)候分散在不同數(shù)據(jù)庫里，甚至沒有公開。

Ocean Census會把這些信息一起都給保留下來。

研究人員除了能看到物種本身，還能同步獲取采樣深度、水溫、鹽度、海底地形以及環(huán)境eDNA數(shù)據(jù)。后續(xù)做生態(tài)分析的人，可以直接調(diào)用這些資料，就不需要再去從零開始、重新尋找原始環(huán)境記錄了。

這也是為什么Ocean Census的數(shù)據(jù)很快被一些國際海洋治理項(xiàng)目關(guān)注。

比如說，國際海底管理局（ISA）在進(jìn)行深海采礦環(huán)境評估時(shí)，需要知道某一區(qū)域有哪些底棲生物、它們分布在哪里、周圍生態(tài)條件如何?！秶夜茌牱秶酝夂Ｑ笊锒鄻有詤f(xié)定》（也叫《海洋生物多樣性協(xié)定》、BBNJ協(xié)定）涉及公海保護(hù)區(qū)劃定時(shí)，也需要類似基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。

過去很多深海區(qū)域的問題是：樣本可能已經(jīng)采到了，但數(shù)據(jù)分散、發(fā)表緩慢，很難形成連續(xù)數(shù)據(jù)庫。Ocean Census的雄心壯志是，想要把這些信息統(tǒng)統(tǒng)給統(tǒng)合、集中起來。

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如何計(jì)算科研貢獻(xiàn)

除了技術(shù)和數(shù)據(jù)平臺，它還調(diào)整了科研貢獻(xiàn)的計(jì)算方式。

傳統(tǒng)分類學(xué)長期存在一個(gè)現(xiàn)實(shí)問題：工作量大，但在現(xiàn)有論文評價(jià)體系里并不占優(yōu)勢。所以很多青年研究者不愿長期做物種鑒定（投入產(chǎn)出比太低）、“分類學(xué)家”落得個(gè)日漸比瀕危物種還瀕危，一個(gè)重要原因就是發(fā)表周期太長。

Ocean Census開始把數(shù)據(jù)整理、數(shù)字檔案建立、開放評議等工作，也納入科研貢獻(xiàn)體系。研究人員提交的DLF檔案、審稿意見和分類校驗(yàn)記錄，都可以綁定DOI、ORCID。

也就是說，科研貢獻(xiàn)不再只看最后那篇論文是誰的一作。這么一來，貢獻(xiàn)者的貢獻(xiàn)積極性自然就高的多了。

小編電腦上貼著玩的一個(gè)sticker。攝影 ?海潮天下（Marine Biodiversity）

這一點(diǎn)對分類學(xué)影響很直接。因?yàn)榇罅炕A(chǔ)工作過去其實(shí)很難被正式記錄，例如某位研究者參與了形態(tài)校驗(yàn)、或者提供了關(guān)鍵比對數(shù)據(jù)，但名字未必會進(jìn)入最終論文?，F(xiàn)在，這些過程本身開始被數(shù)字化保存。至于論文作者list長度呢，不怕長，多多益善是常態(tài)。

當(dāng)然了，從目前的發(fā)展看，Ocean Census并沒有取代傳統(tǒng)分類學(xué)。新物種最終仍然需要遵循現(xiàn)有命名規(guī)則，正式發(fā)表也依然重要。但客觀的講，它確實(shí)改變了物種數(shù)據(jù)進(jìn)入“科學(xué)共同體”的速度。

過去的模式更像“先發(fā)表，再交流”；Ocean Census的創(chuàng)新做法是“先共享，再逐步完成發(fā)表”。

對于深海生物研究來說，這種變化的意義并不只是提高效率。因?yàn)楹芏嗪Ｓ蛘谕瑫r(shí)面臨深海采礦、漁業(yè)擴(kuò)張和氣候變化壓力，如果基礎(chǔ)生物數(shù)據(jù)長期積壓，很多物種可能在正式進(jìn)入科學(xué)記錄之前，就已經(jīng)受到環(huán)境變化影響。

Ocean Census試圖解決的，本質(zhì)上是“發(fā)現(xiàn)速度”vs“發(fā)表速度”之間越來越大的落差。它采用的方法，并不是增加幾本新期刊，而是直接重建了一套圍繞數(shù)字?jǐn)?shù)據(jù)運(yùn)行的協(xié)作系統(tǒng)，或許對于我國建設(shè)世界一流期刊、科學(xué)研究體系的創(chuàng)新也有一定的啟發(fā)。

海潮君·寫在最后

要真正改變一個(gè)領(lǐng)域的運(yùn)行規(guī)則，往往不是靠在舊賽道里多開兩家店，不妨考慮直接換一個(gè)玩法，比如調(diào)整信息生產(chǎn)與流通的基礎(chǔ)結(jié)構(gòu)。Ocean Census提供的，是一個(gè)圍繞深海生物多樣性數(shù)據(jù)組織方式的案例，它并未替代傳統(tǒng)分類學(xué)與期刊體系；它在數(shù)據(jù)采集、數(shù)字化記錄與協(xié)同鑒定環(huán)節(jié)上前移了科學(xué)協(xié)作的起點(diǎn)。這一變化，也給我們觀察科研基礎(chǔ)設(shè)施如何影響知識生產(chǎn)提供了一個(gè)具體的樣本，雖然它成立至今也才不過3年。

從路徑上看，傳統(tǒng)海洋生物分類依賴實(shí)體標(biāo)本在博物館與研究機(jī)構(gòu)之間的流轉(zhuǎn)，以及基于期刊體系的同行評議與正式發(fā)表。這種流程在復(fù)雜類群研究中周期較長，信息公開往往滯后于樣本獲取。Ocean Census的實(shí)踐則是在樣本采集后，通過高分辨率成像、CT掃描、基因測序與環(huán)境DNA數(shù)據(jù)采集等方式，盡可能在早期形成數(shù)字化記錄，使物種信息能夠更快進(jìn)入跨機(jī)構(gòu)共享與分析流程，提升了前期數(shù)據(jù)可見性、降低了跨機(jī)構(gòu)的協(xié)作成本。

在協(xié)作方式上，該項(xiàng)目借助數(shù)字平臺與工作坊機(jī)制，將不同地區(qū)的分類學(xué)研究者連接到同一數(shù)據(jù)環(huán)境中，對潛在新物種進(jìn)行同步觀察與討論。這種模式相較于傳統(tǒng)依賴少數(shù)審稿人的線性同行評議，更強(qiáng)調(diào)多方參與與快速反饋，有助于提升早期鑒定階段的效率。（當(dāng)然了，其學(xué)術(shù)嚴(yán)謹(jǐn)性還是依賴后續(xù)標(biāo)準(zhǔn)分類學(xué)流程的驗(yàn)證、修訂，開放協(xié)作更多體現(xiàn)為一種補(bǔ)充性機(jī)制，而非替代關(guān)系）。

在科研評價(jià)層面，開放科學(xué)體系正在嘗試將數(shù)據(jù)貢獻(xiàn)、代碼維護(hù)與協(xié)作評議等納入可記錄與可追蹤的科研產(chǎn)出形式，例如用DOI、ORCID等標(biāo)識系統(tǒng)來強(qiáng)化貢獻(xiàn)歸屬。這一趨勢在部分國際科研資助、開放科學(xué)實(shí)踐中已多少有體現(xiàn)了，但尚未形成統(tǒng)一的全球性評價(jià)制度。Ocean Census在這一方向上的探索，主要體現(xiàn)在對數(shù)據(jù)貢獻(xiàn)與協(xié)作行為的結(jié)構(gòu)化記錄，而其制度化影響仍處于逐步演化階段，這一點(diǎn)我們未來可以慢慢觀察。

從更宏觀的視角看，這類實(shí)踐反映出科研組織方式的一種變化趨勢：科學(xué)數(shù)據(jù)的生成、共享與協(xié)作分析正在更早階段被整合進(jìn)研究流程之中，這樣一來，知識生產(chǎn)就無需依賴單一發(fā)表節(jié)點(diǎn)完成流通。

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資訊源 | Ocean Census

文 | 王海詩

排版 | 盧曉雨

時(shí)間 | 2026年5月

聯(lián)系小編 | [email protected]

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